Ich glaube der entscheidende Hinweis ist von rase :
Es wäre alles gut gegangen, wenn Du sie nicht zu einer Kälteperiode hin getrennt hättest.
Denn letztlich ist ja wurscht, ob sie nun 3, 4 oder 5 Wochen aufeinander stehen. Nur sollte man aufpassen, dass ein solches Zwei-Königinnen-Volk ggf. Platz braucht ... was ja mittels ASG und HR obendrauf jederzeit möglich ist.
Noch ein Gedanke: wenn Du am WE hinfährst, schau mal genau, ob da noch die Königin liegt. Aggravierende Hypothese könnte noch sein, dass die obere Königin so attraktiv war, dass unten keine mehr wahr ... entsprechend die meisten Pflegebienen oben, und beim Trennen die dann weg und die Flugbienen: übrig bleibt ggf. ein eher jämmerliches Häufchen mit Brut, aber ohne Weisel, Futter und Erfahrung.
Ich gehe aber davon aus, dass Dir Weisellosigkeit beim unteren Teil beim Trennen aufgefallen wäre?!
Keep it up, Gruß, Jörg